MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009484	CGA	2	6	168820	168825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259168
4003	NC_009484	CCT	2	6	168862	168867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259168
4004	NC_009484	TCG	2	6	168879	168884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259168
4005	NC_009484	CAG	2	6	168986	168991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259168
4006	NC_009484	CGG	2	6	169123	169128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259169
4007	NC_009484	GC	3	6	169197	169202	0 %	0 %	50 %	50 %	148259169
4008	NC_009484	GC	3	6	169225	169230	0 %	0 %	50 %	50 %	148259169
4009	NC_009484	CGC	2	6	169242	169247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259169
4010	NC_009484	GCCG	2	8	169266	169273	0 %	0 %	50 %	50 %	148259169
4011	NC_009484	CCGG	2	8	169285	169292	0 %	0 %	50 %	50 %	148259169
4012	NC_009484	GTG	3	9	169370	169378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259169
4013	NC_009484	CGAG	2	8	169383	169390	25 %	0 %	50 %	25 %	148259169
4014	NC_009484	CCG	2	6	169409	169414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259169
4015	NC_009484	CAC	2	6	169420	169425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259169
4016	NC_009484	CCA	2	6	169449	169454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259169
4017	NC_009484	CCCGG	2	10	169472	169481	0 %	0 %	40 %	60 %	148259169
4018	NC_009484	CGC	2	6	169486	169491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259169
4019	NC_009484	GCA	2	6	169518	169523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259169
4020	NC_009484	TCG	2	6	169559	169564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259169
4021	NC_009484	C	6	6	169589	169594	0 %	0 %	0 %	100 %	148259169
4022	NC_009484	GAGCGT	2	12	169609	169620	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148259169
4023	NC_009484	GCC	2	6	169621	169626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259169
4024	NC_009484	CGC	2	6	169651	169656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259169
4025	NC_009484	CAG	2	6	169657	169662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259169
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4029	NC_009484	GCGCG	2	10	169894	169903	0 %	0 %	60 %	40 %	148259169
4030	NC_009484	GCC	3	9	169904	169912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259169
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4033	NC_009484	GCCGG	2	10	169998	170007	0 %	0 %	60 %	40 %	148259169
4034	NC_009484	CG	3	6	170022	170027	0 %	0 %	50 %	50 %	148259169
4035	NC_009484	CGCC	2	8	170071	170078	0 %	0 %	25 %	75 %	148259169
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4042	NC_009484	CGC	2	6	170262	170267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259169
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4044	NC_009484	GGC	2	6	170317	170322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259169
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4059	NC_009484	GCA	2	6	171045	171050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259169
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4061	NC_009484	ATCG	2	8	171106	171113	25 %	25 %	25 %	25 %	148259169
4062	NC_009484	CGG	2	6	171114	171119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259169
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4065	NC_009484	CGC	2	6	171280	171285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259169
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4117	NC_009484	TGC	2	6	172771	172776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259170
4118	NC_009484	GC	3	6	172827	172832	0 %	0 %	50 %	50 %	148259170
4119	NC_009484	CG	4	8	172835	172842	0 %	0 %	50 %	50 %	148259170
4120	NC_009484	GCT	2	6	172853	172858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259170
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4122	NC_009484	CGC	2	6	172919	172924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259170
4123	NC_009484	GTC	2	6	172935	172940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259170
4124	NC_009484	CGC	3	9	172946	172954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259170
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4153	NC_009484	GCT	2	6	173954	173959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259170
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4231	NC_009484	CGCC	2	8	176885	176892	0 %	0 %	25 %	75 %	148259174
4232	NC_009484	GCC	2	6	176932	176937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259174
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4236	NC_009484	CTG	2	6	177092	177097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259174
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4240	NC_009484	CGA	2	6	177233	177238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259174
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4242	NC_009484	GCC	2	6	177300	177305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259174
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4244	NC_009484	CCG	2	6	177349	177354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259174
4245	NC_009484	GCG	2	6	177396	177401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259174
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4248	NC_009484	GC	3	6	177701	177706	0 %	0 %	50 %	50 %	148259175
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4356	NC_009484	CGGCG	2	10	182803	182812	0 %	0 %	60 %	40 %	148259180
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4359	NC_009484	CGA	2	6	182845	182850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259180
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4362	NC_009484	CA	3	6	182941	182946	50 %	0 %	0 %	50 %	148259180
4363	NC_009484	GCC	2	6	182988	182993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259180
4364	NC_009484	CGA	2	6	183010	183015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259180
4365	NC_009484	GAT	2	6	183067	183072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259180
4366	NC_009484	TGC	2	6	183087	183092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259180
4367	NC_009484	TGC	2	6	183216	183221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259180
4368	NC_009484	CCGC	2	8	183234	183241	0 %	0 %	25 %	75 %	148259180
4369	NC_009484	TCG	2	6	183271	183276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259180
4370	NC_009484	CG	3	6	183275	183280	0 %	0 %	50 %	50 %	148259180
4371	NC_009484	GA	3	6	183402	183407	50 %	0 %	50 %	0 %	148259181
4372	NC_009484	CGA	2	6	183445	183450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259181
4373	NC_009484	GGTC	2	8	183462	183469	0 %	25 %	50 %	25 %	148259181
4374	NC_009484	ATC	2	6	183473	183478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259181
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4379	NC_009484	CGC	2	6	183667	183672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259181
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4381	NC_009484	CCGC	2	8	183740	183747	0 %	0 %	25 %	75 %	148259181
4382	NC_009484	GC	3	6	183751	183756	0 %	0 %	50 %	50 %	148259181
4383	NC_009484	GCC	2	6	183776	183781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259181
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4385	NC_009484	CCGCGC	2	12	183844	183855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259181
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4390	NC_009484	TCG	2	6	184065	184070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259181
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4393	NC_009484	TCG	2	6	184119	184124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259181
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4403	NC_009484	GCC	2	6	184376	184381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259181
4404	NC_009484	CG	3	6	184405	184410	0 %	0 %	50 %	50 %	148259181
4405	NC_009484	TCA	2	6	184425	184430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259181
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4421	NC_009484	CCG	2	6	184883	184888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259182
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4437	NC_009484	TCG	2	6	185473	185478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259183
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4439	NC_009484	GCCC	2	8	185542	185549	0 %	0 %	25 %	75 %	148259183
4440	NC_009484	GAC	2	6	185561	185566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259183
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4442	NC_009484	CCG	2	6	185617	185622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
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4445	NC_009484	CGC	4	12	185670	185681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
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4448	NC_009484	TCG	2	6	185704	185709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259183
4449	NC_009484	CAG	2	6	185736	185741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259183
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4452	NC_009484	GTCCTC	2	12	185847	185858	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148259183
4453	NC_009484	CGC	2	6	185859	185864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
4454	NC_009484	CGA	3	9	185867	185875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259183
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4459	NC_009484	GATGGC	2	12	185970	185981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148259183
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4462	NC_009484	CGA	2	6	186038	186043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259183
4463	NC_009484	CCA	2	6	186055	186060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259183
4464	NC_009484	CGCC	2	8	186065	186072	0 %	0 %	25 %	75 %	148259183
4465	NC_009484	GCC	2	6	186075	186080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
4466	NC_009484	GAG	2	6	186099	186104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259183
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4469	NC_009484	CGCC	2	8	186215	186222	0 %	0 %	25 %	75 %	148259183
4470	NC_009484	CGC	2	6	186287	186292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
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4472	NC_009484	GCC	2	6	186405	186410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
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4474	NC_009484	GCC	2	6	186417	186422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
4475	NC_009484	GCC	2	6	186443	186448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
4476	NC_009484	CCGCC	2	10	186587	186596	0 %	0 %	20 %	80 %	148259183
4477	NC_009484	GCC	2	6	186625	186630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259183
4478	NC_009484	TGC	2	6	186631	186636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259183
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4481	NC_009484	GC	3	6	186805	186810	0 %	0 %	50 %	50 %	148259184
4482	NC_009484	CGC	2	6	186829	186834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259184
4483	NC_009484	CCG	2	6	186854	186859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259184
4484	NC_009484	AATG	2	8	186905	186912	50 %	25 %	25 %	0 %	148259184
4485	NC_009484	CCG	2	6	186978	186983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259184
4486	NC_009484	GGC	2	6	186998	187003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259184
4487	NC_009484	CGC	2	6	187054	187059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259184
4488	NC_009484	CGC	2	6	187132	187137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259184
4489	NC_009484	CGC	2	6	187147	187152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259184
4490	NC_009484	TCG	3	9	187194	187202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259184
4491	NC_009484	CGG	2	6	187252	187257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259184
4492	NC_009484	GC	4	8	187266	187273	0 %	0 %	50 %	50 %	148259184
4493	NC_009484	CCCGC	2	10	187275	187284	0 %	0 %	20 %	80 %	148259184
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4497	NC_009484	CGCC	2	8	187504	187511	0 %	0 %	25 %	75 %	148259184
4498	NC_009484	CG	3	6	187530	187535	0 %	0 %	50 %	50 %	148259184
4499	NC_009484	CGGC	2	8	187537	187544	0 %	0 %	50 %	50 %	148259184
4500	NC_009484	ACC	2	6	187580	187585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259184

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